住房保障服务中心设9个内设机构：

一、办公室

协调局机关政务工作。负责机关文电、综合调研、会务、机要、档案、政务公开、督查督办、政务协调、宣传信息、安全保密工作；负责行政后勤和接待工作；负责综合治理、治安保卫、消防等工作。

二、人事股

负责局机关和所属单位的机构编制、人事调配、人员管理、劳动工资、社会保险和职称评聘报批工作，职工培训教育。

三、财务股

管理全局财务财产、计划和综合统计工作；管理全局事业资金收支和行政事业性收支；负责全局经济核算、国有资产管理、费用审核、财务人员培训；负责对各项资金使用情况实行内部审计监督。

四、工会

负责职工培训教育、计划生育工作，协同行政部门办好职工集体福利事业，做好职工疗休养工作及劳动安全保护工作。

五、经营管理股

管理全市城镇国有直管公房的产权，确定直管公房的租赁价格和租金基数，并负责组织、监督其租金收缴工作；协助处理国有直管公房的租赁纠纷；负责直管公房的出售工作；参与直管公房的拆迁改造；负责局属各房管所发生的经济合同的审查把关；负责全局房屋新建、改建和修缮工程的规划设计及工程预决算、工程质量、安全生产等工作；参与本市行政区域内土地使用权出让方案的拟定，负责土地二、三级市场的经营管理工作。

六、法制股

负责全局依法治理和法制宣传教育工作，组织开展房地产行政执法并进行指导、监督；负责有关房地产行政管理规范性文件的起草、报批工作；负责信访接待、提案办理工作；调处各类房地产纠纷，审核房地产相关合同、协议及行政执法各类文书。

七、党建办

及时掌握中央、省、市党委精神，在全中心范围内开展好党建工作；负责负责党的建设、党员学习培训，指导基层党组织开展党内政治生活；配合开展好上级组织部门提出的各类主题活动；及时提出新的党建工作思路，打造地区党建亮点；

八、纪检监察室

承担局机关及所属单位的纪律检查和行政监察的日常工作。

九、深化改革办公室

负责组织开展全中心全面深化改革重大问题的政策研究，统筹协调有关方面提出的改革工作方案和措施，提出中心中长改革规划建议，协调督促有关方面落实深化改革领导小组的决定事项，工作部署和要求承担深化改革领导小组日常有关工作。