直属二级机构有沅江市林业综合行政执法大队（副科级参照公务员法管理单位）、沅江市森林病虫害防治保护站、沅江市湿地保护站、沅江市琼湖国家湿地公园事务中心、沅江市林木种苗和技术推广站、沅江市林业调查事务中心、沅江市南洞庭湖风景名胜事务中心、沅江市林长制事务中心。独立二级机构有湖南省沅江市龙虎山国有林场（沅江市龙虎山省级森林公园管理所）、沅江市苗圃场（沅江市目平湖林芦站）、沅江市林业科学研究所。